| LMMsolver | Linear Mixed Model Solver Martin Boer , Bart-Jan van Rossum |
| SpATS | Spatial Analysis of Field Trials with Splines Maria Xose Rodriguez-Alvarez , Martin Boer , Paul Eilers , Fred van Eeuwijk |
| statgenGWAS | Genome Wide Association Studies Bart-Jan van Rossum , Willem Kruijer , Fred van Eeuwijk , Martin Boer , Marcos Malosetti , Daniela Bustos-Korts , Emilie Millet , Joao Paulo , Maikel Verouden , Ron Wehrens , Choazhi Zheng |
| statgenGxE | Genotype by Environment (GxE) Analysis Bart-Jan van Rossum , Fred van Eeuwijk , Martin Boer , Marcos Malosetti , Daniela Bustos-Korts , Emilie J Millet , Joao Paulo , Maikel Verouden , Willem Kruijer , Ron Wehrens , Choazhi Zheng |
| statgenHTP | High Throughput Phenotyping (HTP) Data Analysis Emilie J Millet , Maria Xose Rodriguez Alvarez , Diana Marcela Perez Valencia , Isabelle Sanchez , Nadine Hilgert , Bart-Jan van Rossum , Fred van Eeuwijk , Martin Boer |
| statgenIBD | Calculation of IBD Probabilities Martin Boer , Bart-Jan van Rossum , Wenhao Li , Johannes Kruisselbrink |
| statgenMPP | QTL Mapping for Multi Parent Populations Wenhao Li , Martin Boer , Bart-Jan van Rossum , Fred van Eeuwijk |
| statgenQTLxT | Multi-Trait and Multi-Trial Genome Wide Association Studies Bart-Jan van Rossum , Willem Kruijer , Fred van Eeuwijk , Martin Boer , Daniela Bustos-Korts , Emilie J Millet , Joao Paulo , Maikel Verouden , Ron Wehrens , Choazhi Zheng |
| statgenSTA | Single Trial Analysis (STA) of Field Trials Bart-Jan van Rossum , Fred van Eeuwijk , Martin Boer , Marcos Malosetti , Daniela Bustos-Korts , Emilie J. Millet , Joao Paulo , Maikel Verouden , Willem Kruijer , Ron Wehrens , Choazhi Zheng |